Суперкомпьютерное моделирование. Препараты от гепатита заблокировали коронавирус

Новости

Частицы вируса SARS-CoV-2 на клетках, снимок в ложном цвете (фото — NIAID)

Благодаря методу компьютерного моделирования молекулярной «стыковки» (быстрее и дешевле, чем лабораторные тесты) найдены перспективные препараты

Вычисления на суперкомпьютере MOGON II в Майнцском университете Гутенберга (JGU) определили вещества, которые могут быть потенциальными лекарствами против коронавируса SARS-CoV-2. Об этом говорится в пресс-релизе Института Гельмгольца, который опубликовала также Всемирная организация здравоохранения.

Ученые два месяца моделировали процесс сцепления молекул около 42 000 веществ из открытой базы данных с определенными участками вирусных частиц. Благодаря такому процессу можно подобрать те молекулы, которые заблокируют механизм проникновения патогена в клетки организма.

За период вычислений было проверено около 30 млрд вариантов молекулярного докинга (того самого сцепления, о котором выше) с гликопротеиновым шипом коронавируса, белками нуклеокапсида и ферментом 2’о-рибозной метилтрансферазой.

Исследователи выяснили, что несколько соединений, в том числе вещества из четырех лекарств от гепатита С (симепревир, паритапревир, гразопревир и велпатасвир), могут «очень сильно» связывать активные зоны вирусных частиц.

Суперкомпьютерное моделирование. Препараты от гепатита заблокировали коронавирус

Суперкомпьютерное моделирование. Препараты от гепатита заблокировали коронавирус

Суперкомпьютерное моделирование. Препараты от гепатита заблокировали коронавирус

«Мы обнаружили ряд одобренных лекарств от гепатита С в качестве многообещающих кандидатов на лечение. Наши выводы подтверждаются тем, что SARS-CoV-2, как и вирус гепатита С, является одноцепочечным РНК-вирусом. Результаты теперь необходимо проверить в лабораторных экспериментах и клинических исследованиях», — говорит ведущий автор исследования, профессор Томас Эфферт.

По словам ученых, вещество из японской жимолости (Lonicera japonica) также может стать «еще одним сильным кандидатом против SARS-CoV-2».

Эфферт напомнил, что молекулярный докинг успешно использовался при поиске активных веществ против коронавирусов MERS-CoV и SARS-CoV, а с той поры вычислительные мощности сильно шагнули вперед.

  • В марте проект Стэнфордского университета Folding@home начал искать средства против COVID-19 и призвал юзеров подключать свои ПК для помощи.
  • Спустя месяц суммарный потенциал этого проекта обогнал 500 лучших суперкомпьютеров современности.
Поделиться с друзьями
Коронавирус Онлайн
Добавить комментарий